最主要的防霉措施是控制原料及貯存時的溫度、濕度，即原料中水分和儲存環境中的溫度和濕度。其方法主要有：
1、嚴格控制飼料原料的水分含量：
一般要求玉米、高粱、稻谷中的水分不超過14%；大豆及其餅粕、麥類、次粉、糠麩類、甘薯干、木薯干不超過13%；棉籽餅粕、菜籽餅粕、向日葵仁餅粕、亞麻仁餅粕、花生仁餅粕、魚粉、骨粉及肉骨粉不超過12%。
2、原料貯存時的防治措施
在原料貯存中，一定要注意空氣、濕度、溫度等的控制，要嚴格按照”先進先出”的使用原則，要及時清理已被污染的原料，可使用的方法有：控制貯存環境的溫度、封閉隔氧貯存、氣調貯存、低溫通風貯存及輻射法，例如把脫粒后的濕玉米裝入內襯塑料袋的麻袋，裝滿并扎緊袋口可抑制黃曲霉的生長，也可以添加防霉劑（如丙酸及其鹽類、山梨酸及其鹽類、雙乙酸鈉等）。
3、飼料貯存中的防治措施
倉庫要通風、陰涼、干燥、清潔，沒有霉積料。其次堆入要規范，應與窗、壁保持一定的距離，貯存時間長的話還要定期翻動通風。再次是防霉劑的使用。
在飼料中添加的化學防霉劑種類很多，可分為單方和復方兩大類，單方多用丙酸鹽類防霉劑，如克霉靈、除霉凈、霉敵101、露保細、萬路保、克霉霸、露保細鹽、露保細NC，具體使用方法是：密封包裝的含水量12.5％～13.5％的顆粒料貯存1個月以上，應添加0.3％的丙酸鈣。水分在11.55％～12.5％的粉料貯存2月以上的則加丙酸鈣0.15％。南方地區由于雨水較多，3～5月間最好添加0.2％～0.4％的丙酸鈣或丙酸鈉。除丙酸及其鹽類外，還可用山梨酸及其鹽類、苯甲酸和苯甲酸鈉、甲酸和甲酸鈉、甲酸鈣、馬酸二甲酯及大蒜素等。這些防霉劑具有破壞或阻斷病原微生物的作用，但又不會阻礙消化道中正常有益菌群和酶的活動，有的還能改善飼料的口味和提高飼料的適口性品質。為了提高防霉劑的防霉能力和綜合品質，除了使用單方防霉劑以外，目前國際上多采用復合型的防霉劑，如萬香保、克霉霸等。
復方防霉劑的廣譜抗菌防霉能力更強，適用范圍更寬。日本在飼料中經常使用的復方防霉劑有：
a.用92%海藻物、4%碘酸鈣、4%丙酸鈣組成，使用時按8%的比例添加到飼料中，這種防霉劑除了防霉效果好以外，最大特點是增加了海藻物中各種微量元素，如鈣、鐵、鋅、碘、銅等，使飼料中的微量元素更豐富。
b.用1份醋酸鈉和2份醛酸混合均勻，然后在混合物中加入1%的山梨酸，充分攪拌并干燥即可。使用時按1%比例加入到飼料中。
c.用1份碳酸鈉和2份醛酸混合均勻，然后在混合物中加入1%的山梨酸，充分拌勻并干燥，使用時按1%的比例加入到飼料中。
不管使用單方或復方防霉劑，一般都不要與堿性物質混合使用，以增強防霉的效果。